功能性消化不良的治疗方法有一般治疗和药物治疗。
1.一般治疗：功能性消化不良，需要养成良好的生活习惯，尽量戒烟戒酒，合理膳食，规律作息。
2.药物治疗：功能性消化不良，需要在医生的指导下使用奥美拉唑、莫沙必利、氢氧化铝凝胶、泮托拉唑等药物进行治疗。
日常生活中，应当注意充分休息，保证充足的睡眠时间，饮食方面应当忌食生冷油腻食物。