一般情况下，小儿功能性消化不良要做一般检查、胃镜检查。
一般检查包括现病史、既往史等询问，全身体格检查，了解患儿以前得过什么病，检查身体状况。胃镜检查主要是用于明确是否存在胃肠道疾病，排除可以解释症状的器质性疾病。功能性消化不良一经确认以后，应该遵医嘱给予对症治疗，缓解病人的症状，提高病人的生活质量。