功能性消化不良可通过药物治疗、日常调理的方式进行处理。
进食的食物超过胃肠道的消化吸收能力可能会引起功能性消化不良，建议患者在医生的指导下服用补充消化酶和调节肠道菌群的药物。此外，日常生活中，患者要注意饮食健康，戒烟戒酒，以清淡和易消化的食物为主，忌辛辣刺激及油炸的食物，多吃新鲜的水果和蔬菜，少食多餐，不要暴饮暴食，保持心情舒畅，适当运动，比如慢跑、游泳等，有利于身体健康。