上消化道器官通常被称作上消化道，即从口腔处至屈氏韧带之上。主要是口腔、咽、食管、胃、十二指肠、胰腺、肝、胆囊等。食管、胃、十二指肠是最常见的器官。
常见的症状有：反流性食管炎、胃炎、十二指肠球溃疡等。此外，胰腺常见的疾病有急性胰腺炎、胰腺癌，肝脏常见的疾病有多种类型的肝炎、肝硬化等。急性胆囊炎和胆管癌是胆囊的主要症状。