造成腹痛腹泻的原因有很多，如过量食用乳制品，麸质食物，油腻多脂食物，酒精或咖啡因。
慢性腹痛腹泻也可能由药物引起，癌症治疗也可引发腹痛腹泻。其他可以导致慢性腹痛腹泻的疾病，肠易激综合征，克罗恩病，溃疡性结肠炎，糖尿病。对于IBS患者，对疾病的焦虑会加剧腹痛腹泻症状。药物或生活方式的改变有助于降低症状发作频率。有时糖尿病也可导致腹痛腹泻发生。
饮食上，避免吃生冷的食物以及油腻的食物。如果是胃肠炎引起的腹泻，在多吃流质饮食的基础上，可以多吃烤蒜等食物，有杀菌止泻作用。