肛瘘早期会出现肛门流脓，有粘性分泌物。肛瘘初期是肛周脓肿，破溃后形成肛瘘，它是肛隐窝感染引起的，和直肠末端相通，肠液粪水及细菌都有可能流入，手术是必须的。因为只有进行手术，才能找到原发的内口，并把感染的肛窦、肛门腺及其导管切除干净。