肛瘘主要是由于肛窦腺体发炎，形成肛门直肠周围脓肿，脓肿破溃发展而来，或肛周脓肿术后引流不畅成为外口，脓肿逐渐缩小，形成感染性管道，肛瘘有1个内口和1个外口，瘘管行走在肛门内外括约肌附近，常迂曲，引流不畅，而外口皮肤生长较快，从形成假性愈合。