子宫内膜异位有痛经的风险，此时的痛经是继发性、渐进性的，一般出现在经期的前1-2日，头一日最为剧烈，但是之后对随着时间疼痛会慢慢减轻，痛经后痛感会减轻；也会导致不育，几率约为40-50%；子宫内膜移入直肠、盆腔后会有便秘、里急后重、腹泻等症状；移植到尿道部位，可能会发生周期性尿频、尿急、尿痛等症状。