女性非淋菌性尿道炎多无症状。当有尿道炎时，约有一半病人有尿急尿频及排尿困难，但无尿痛症状或仅有轻微尿痛。宫颈是女性主要感染部位，可有白带增多，外阴阴道痉痒及下腹部不适等症状。尿道口可有潮红和肿胀，可压迫尿道可有少量淡黄色分泌物。用白色棉拭子插人宫颈口后稍加转动，取出后肉眼可见拭子变为浅黄色。宫颈充血，水肿也常发生，用拭子在交界处转动会引起出血。