怀孕初期胚胎发育不良，可能是由于卵子的质量和精子的质量较差，受精卵形成后由于受到细菌、病毒、药物、辐射等的不利影响，或者是由于遗传、染色体等方面的原因，导致胚胎发育不良。可能是子宫内膜较薄，内膜的营养不丰富，受精卵移植到宫腔后接受不到足够的营养供应，也会出现胚胎发育不良。