妊娠前期胚胎生长缓慢主要是由于胚胎自身发育不良，夫妇两个染色体异常，男性精子品质差，或者患有妇科炎症，或者孕酮偏低，或者在妊娠前期，由于接触了太多的有毒、有害的物质或者X线，造成了胎儿的生长不良。
但是也有人认为这并不是因为发育缓慢，而是因为怀孕后期，如果按照末次月经计，那么孕周就会和B超上显示出来的时间不一致，会被误认为是发育缓慢。