采取治疗时，首先需辨别是甲状腺良性腺瘤、甲状腺慢性炎症还是甲状腺癌是第一个面临的难题。临床医生通常可通过病史体检并配合必要的辅助检查而获得一初步判断。
若疑似患有恶性甲状腺疾病，此时就要进行穿刺了，在临床上我们通常会选用细针穿刺或彩超指引甲状腺穿刺。
如甲状腺结节生长较快、质地坚硬、活动度较差、淋巴结肿大、声音嘶哑、吞咽困难或呼吸困难等，对甲状腺癌可能性有较高疑虑，此时可考虑穿刺或直接手术。