胚胎发育不好的原因很多，主要与父母身体素质差有关，比如父母抽烟喝酒，熬夜等不良习惯可能会导致胚胎发育不良。也与遗传因素和环境因素有关。母亲有高血压，糖尿病，心脏病，慢性肾炎，贫血等也可能会导致胎儿发育不良。出现胚胎发育不良的情况发生，男方和女方都需要进行一系列检查，男方可以查一下精液常规，女方需要查一下甲状腺功能，优生四项等。