胚胎发育不良主要是因为胚胎的染色体异常。包括胚胎的染色体数目异常、结构异常。还有就是母体有全身性的疾病，比如高热、梅毒、严重贫血或者有高血压、糖尿病、甲状腺功能异常、母体胎儿血型不合、子宫发育不全、子宫肌瘤、双子宫、宫颈口松弛、子宫内膜炎、以及外伤刺激、精神高度紧张、焦虑、恐惧、吸毒、酗酒、抽烟、环境因素等都是造成胚胎发育不良的原因。