喝酵素肚子咕噜咕噜可通过停止用药、日常调理等方式进行治疗，具体如下：
酵素是用小麦、米的胚芽以及大豆等植物原料,用乳酸菌或者酵母发酵以后所成的发酵食品，可以促进肠胃蠕动。喝酵素出现这一症状为正常现象，一般无需担心。如果伴有其他不适，应停止使用。
日常生活中，应该保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，适当运动，增强机体免疫力，避免食用油腻、辛辣类食物。