一般情况下，阴茎里长小肉疙瘩是病毒感染造成的，具体内容如下：
如果患者曾发生过不洁性行为，可能会感染人体乳头瘤病毒，可能会诱发尖锐湿疣，可能导致阴茎里长小肉疙瘩，随着病情发展，甚至还会变成菜花样。因此，患者应及时就诊进行治疗，可以通过激光烧灼、液氮冷冻等方式进行物理治疗，以去除疙瘩，然后在外用干扰素软膏进行抗菌处理。