手足口病的潜伏期通常为2-10天，平均为3-5天。一般在发热1-2天后，口腔黏膜可出现疼痛的粟粒性水疱。同时，手、脚、臀部等部位可出现红色斑丘疹或疱疹。有些孩子只出现皮疹或疱疹性咽峡炎，但有些孩子没有皮疹。在发病初期，患者常表现为乏力、食欲不振、低热、身体不适、腹痛等前驱症状。一般自然病程1周左右，少数患者发病后2-4周可出现指甲脱落。