手足口病后指甲可能会掉，需要根据病情来判断，具体分析如下：
手足口病是一种常见的传染病，主要发生于婴幼儿。一些儿童在手足口病康复过程中，会出现手部、脚部脱皮、指甲脱落等情况。孩子的指甲脱落主要是因为病毒侵入了指甲，导致甲母质功能暂时受到抑制，从而造成指甲生成障碍，也有一些家长认为是继发细菌感染造成。但是指甲脱落后的几天到一个半月就会重新长出新的指甲。在这段时间里，要注意对指甲的保护，保持局部的干净和防止感染。