上火肛门疼痛用的药物有以下几种：
1.患者可以用苦参、黄柏、马齿苋、蒲公英等药物熏洗肛门；
2.患者也可以口服中药汤剂，具有清热泻火、补中益气类的药物，如补中益气丸合白头翁汤或者芍药散。建议患者于当地医院的肛肠科就诊，以排除痔疮、肛周脓肿等疾病。需要患者结合检查结果，明确诊断后再治疗，不能擅自用药，需要遵医嘱。