肛门疼痛的处理，需要先确诊诱发肛门疼痛的病因。如果肛门疼痛是肛周脓肿引起的，那么早期的肛周脓肿可以通过静脉使用药物。肛周脓肿成熟了，则需要手术切除治疗，缓解肛门疼痛症状。如果肛门疼痛是由炎性外痔、血栓性外痔引起的，那么需要采用手术切除外痔治疗。