尿频、排尿刺痛、尿道口红肿、有少量粘液性分泌物是男性支原体感染的主要表现。男性支原体感染后，会出现尿道的炎症反应，这是由于支原体的宿主是尿道粘膜。支原体感染的典型临床症状是尿道发炎，小便刺痛，用手指挤压阴茎会有白色的分泌物渗出。男性支原体感染一般不会出现淋病的症状，尿路流出的分泌物为乳白色，淋病则是大量的黄色脓性分泌物。