急性上呼吸道感染的病因有细菌和病毒感染所引起的。有百分之七八十是由于病毒感染所引起的，例如冠状病毒和鼻病毒。剩下的百分之二三十是由于呼吸道感染细菌所引起的，例如溶血性链球菌和口腔定植菌。另外由于淋雨或过度疲劳导致全身或呼吸道局部防御功能降低，导致原存的细菌或病毒快速繁殖。也可能是直接接触病原体通过飞沫传播或空气传播导致的感染。