甲状腺球蛋白偏低的原因有很多，甲状腺球蛋白是由甲状腺滤泡上皮细胞合成，在甲状腺合成激素的生产线上，碘和酪氨酸由甲状腺球蛋白合成、组装而成。
甲状腺球蛋白的多少反映甲状腺完整性，甲状腺球蛋白低则可能是先天性甲状腺发育不全、甲状腺缩小或萎缩、甲状腺炎症、手术破坏导致甲状腺损伤。此外，测定甲状腺球蛋白对甲状腺癌手术后定期复查、评估甲状腺癌复发的风险非常重要。