衣原体感染两年了可以通过药物治疗来改善，还需要进行生活护理。
可以采取抗生素治疗，主要是口服大环内酯类抗生素，比如红霉素，或者是喹诺酮类抗生素，比如左氧氟沙星等，可以起到消炎、消毒的效果。多喝开水或者是喝稀饭，可以促进身体的新陈代谢，对咳嗽等症状也有一定的帮助。保证充足的睡眠，身体是有自我修复能力的，充足的睡眠对身体的康复是非常有益的，可以起到一定的辅助作用。在日常生活中要避免吃辛辣刺激的食物。

衣原体感染可以通过口服药物、静脉注射等方式进行治疗。
1、药物治疗：如果发现有衣原体感染，可以在医生的指导下口服罗红霉素胶囊、阿奇霉素分散片等抗生素进行治疗。
2、静脉输液：如果病人的情况很严重，光靠上述方法是无法缓解的，可以通过静脉输液来缓解。

肺炎衣原体咳嗽可以服用一些消炎止咳的药物来进行治疗，如果没有效果也可以进行输液。衣原体肺炎会出现咳嗽，咳痰，身体发热，脸色苍白，四肢无力，头晕头痛平时一定要注意保暖，避免着凉。

妊娠合并生殖道沙眼衣原体感染，具体分析如下：
这种情况可能会造成胎儿流产，严重的还会造成胎儿畸形。因此，一般的医生都会推荐口服阿奇霉素，这样才能使衣原体的感染得到缓解。但如果使用阿奇霉素后，沙眼衣原体还没有好转，那么胎儿就会正常生长，不需要进行特别的治疗。如果在这个时候检查出了胎儿的异常，那么建议进行人工流产。

对泌尿生殖道支原体和衣原体感染治疗、多采用四环素类、大环内酯类、喹诺酮类及大观霉素、克林霉素等抗生素、一般疗程为7～10天.如果细菌培养发现有耐药菌株存在，进行药物敏感试验、以便选择敏感药物进行治疗。

衣原体感染不容易治疗，衣原体感染是性病一种最难治疗，病会反复复发必须与有性关系的人同时治疗期间不能有性生活已经感染到附睾炎说明感染没有控制住尽快去医院彻底治。

考虑泌尿系统感染引起的，需要进一步尿常规化验确诊。应多饮水，以增加尿量，对尿道有冲洗作用。日常生活中在饮食上要忌辛辣烟酒，不要熬夜，放松心情，不要有过多的心理负担。

衣原体感染选用有效抗生素治疗，有效治疗的疗程需7天-21天。经积极治疗，大部分预后良好。但其感染后获得的特异性免疫力较弱，持续时间短，易反复感染，清除不完全可造成持续感染。注意个人卫生，避免传染给他人；遵医嘱按疗程服药。

衣原体感染注意多喝热水，多排尿，促进代谢，注意做好个人卫生管理，亲戚会应及时更换内裤，口服药物进行治疗，遵医嘱情况下使用，治疗一周后化验尿常规，恢复正常后考虑停药。

衣原体感染要看是哪个部位，如果是肺部衣原体感染，那么多表现为咳嗽，干咳等感冒症状。对于肺炎衣原体感染治疗上主要以氨基糖甙类抗生素为首选药物。另外可以应用止咳药物对症治疗，多饮水，多休息，多吃蔬菜水果。