问题分析:这两个是属于不同的疾病,子宫内膜异位症是由于子宫内膜移位于正常的宫腔向宫腔以外的组织生长,巧克力囊肿一般是由于体内的激素水平升高,形成的淤血块,发现之后立即通过手术进行切除之后再做个病理,子宫内膜异位症会导致进行性痛经,也可以通过手术进行治疗,或者是使用一些激素类的药物进行治疗。