牙周炎相对于口腔溃疡是相互独立的，一种是牙周组织疾病，一种是口腔黏膜疾病，两种疾病的诱发因素也是不一样的。
牙周炎的主要始动因子是牙菌斑以及牙结石的局部附着引起，而口腔溃疡是由于某些遗传、免疫以及环境的因素所导致的口腔黏膜局部营养通道堵塞引起。
牙周炎引起的病损主要体现在整个牙体支持组织，比如牙龈萎缩、牙槽骨吸收、牙根暴露以及牙齿的松动移位，而且还是一种非自限性疾病，只要不进行治疗的话症状会不断恶化，还有可能引起远处转移。口腔溃疡引起的病损主要是口腔黏膜处，这是一种自限性疾病，也就是说会持续一段时间以后会自愈，因此只要在患病期进行适当的辅助治疗即可。