乙肝小三阳多数患者病毒水平可能较低、传染性较弱，肝功能正常者，这部分病人可无严重易发展成肝硬化。
部分乙肝小三阳由于乙肝病毒C区变异所致，病毒水平将长期保持相对高水平，就会导致肝脏反复的损伤，在肝脏多次受损后，则易形成肝硬化。临床上所见肝硬化中，乙肝小三阳状态的确占了很大比例。
肝硬化必须接受标准抗病毒和其他治疗，乙肝小三阳患者无肝硬化时，具有抗病毒治疗指征者，规范抗病毒治疗，通常不会发展为肝硬化。