小儿脓毒症大部分可以治疗好，但有少部分严重感染或者累及多器官的治疗不好。
如果小儿脓毒症没有合并其他的基础疾病，一般通过规范治疗可以治好。脓毒症主要是给予改善循环，抗感染等治疗，通过药物可以控制感染，防止疾病持续加重。
如果小儿脓毒症同时合并有严重的基础疾病，例如淋巴瘤白血病等，治疗好的几率相对较低。
小儿脓毒症主要是由感染所引起，比如胆管炎、腹膜炎、肺炎等。在治疗期间要时刻观察脉搏、体温、血压变化，根据病情随时调整药物。