子宫发育不良可能是先天性因素决定的，例如先天性幼稚子宫，另外还可能和青春期内分泌紊乱，卵巢的一些疾病有关系，特别是卵巢功能障碍引起雌、孕激素分泌不足所造成的。而卵巢功能降碍除了会使子宫发育不良外，更大的不利因素是这样的病人常常也没有排卵或者黄体功能不全。