阴茎刺痛在临床上是十分常见的一种症状，可以由非淋球菌尿道炎引起。尿道炎主要是由于支原体衣原体感染引起的，这属于一种性传播疾病，通过不洁的性交互相传染，人体的尿道黏膜是支原体衣原体良好的宿主。它们在尿道黏膜引起炎症反应，造成排尿时阴茎刺痛，尿道分泌物增多。