前列腺囊肿通过跑步不可以自愈。囊肿形成的原因有，胚胎期时前列腺腺体发育受阻，中肾导管与中肾旁管发育异常，坚韧的前列腺基质导致腺泡不完全或间断性梗阻，使腺泡上皮变厚，引起潴留性囊肿。炎症性囊肿前列腺慢性炎症引起结缔组织增生，导致前列腺导管狭窄、分泌物潴留形成囊肿。寄生虫性囊肿寄生虫引起前列腺管及周围发生慢性炎症；或由肉芽增生，逐渐形成囊肿。具体需要根据原因和囊肿的大小进行治疗。