男性位于龟头、冠状沟、阴囊、尿道口或阴茎体;女性位于会阴部、肛门周围、大腿或臀部，约有90%同时侵犯子宫颈。有的原发疱疹仅仅累及子宫颈，故而易被忽略。感染的疱疹病毒时，宫颈外观可以正常或潮红，或伴有多个散在的溃疡。而该病毒对阴道的损害不多见。