急性附睾炎一般复发的机率是不大的，急性附睾炎如果不及时治疗会转成慢性附睾炎。急性附睾炎最严重的并发症是脓肿形成和睾丸梗死。前者往往是由于治疗不及时或治疗不当所致；后者则是精索血管血栓形成或因精索血管受压所致的睾丸缺血性坏死。另一个并发症就是不育，多见于双侧附睾炎，淋病性附睾炎不育发生率更高。