前列腺炎影响性功能可以抗菌治疗，前列腺液培养发现致病病原体是选择抗菌药物治疗的依据。非细菌性前列腺炎病人若有细菌感染征象，经普通疗法治疗无效，亦可适当采用抗菌药物治疗。抗菌药物的选择需注意前列腺腺泡与微循环间存在由类脂膜构成的前列腺血屏障，从屏障妨碍水溶性抗生素通过，大大降低治疗效果。