一般来说，真菌感染龟头炎可以使用药物治疗。
白色念珠菌感染会导致真菌感染性龟头炎，局部可用5%的碳酸氢钠溶液或高锰酸钾粉1:5000外洗，局部可用硝酸咪康唑软膏或克霉唑软膏外用。每日早晚用，彻底恢复要花4到6个星期。在治疗过程中，由于真菌具有极高的传染性，很容易发生交叉感染，所以穿着的内衣要用热水烫一下，放在阳光下曝晒，细菌在高温下很容易被杀死。