通常情况下，多发性宫颈囊肿原因是宫颈糜烂新生上皮，堵塞腺管口导致的。具体情况分析如下：在修复过程中，宫颈转化区新生鳞状上皮细胞逐渐取代柱状上皮细胞，当新生鳞状上皮细胞覆盖宫颈腺管口，或者伸入宫颈腺管，堵塞腺管口，当腺管周围的结缔组织增生或疤痕形成时，由于腺管狭窄，甚至阻塞，腺体分泌物引流受阻，潴留形成多发性宫颈囊肿。