生殖感染给人类健康带来的危害有很多方面，一旦被感染不能够迅速得到救治，不但可能伤害人的生殖器官，甚至还可能引起不孕等疾病，某些生殖感染也可损害人的心、脑等重要脏器，甚至造成死亡。
有些生殖器官感染后难以愈合，例如生殖器疣、生殖器疱疹等，许多生殖感染病人症状较轻或者不明显，但是可以以多种形式传给其他健康者。