人乳头瘤病毒以抗病毒联合免疫调节剂的疗效最显着。对于有高危因素的患者应积极预防和控制病毒感染，并对其进行早期诊断与及时有效地治疗。可以选用干扰素、肌注卡介菌多糖注射液，调节机体免疫功能。还可采用口服药物，例如转移因子或胸腺肽提高机体的免疫功能等。
对于患有严重疾病的患者要进行手术治疗或放疗，对机体免疫力低下者需要采用免疫抑制疗法。当机体免疫功能得到恢复时，自动去除人乳头瘤病毒，身体渐渐康复。在疾病恢复期，需要进行健康指导和饮食调养。康复过程中加强锻炼身体，生活要有规律。