肌腱鞘囊肿由于长期与肌腱层的摩擦，导致其分泌大量的液体。通常与腱鞘炎、脂肪瘤、腱鞘巨细胞瘤等相区别。
肌腱鞘囊肿与某些肿瘤相关，比如局部的皮肤油脂腺囊肿、神经鞘瘤、局部的脂肪瘤等。腱鞘囊肿一般不会有什么特别的表现，一般不会有什么特别的表现，一般都可以通过做超声波来明确两者的区别，最重要的就是做外科手术，再做病理检查。