怀孕三个月是不能直接做无痛人流手术，选择终止妊娠的，无痛人流手术适用于怀孕10周以内的，应先及时去医院进行检查，保持一个良好的生活习惯，可以先口服药物软化宫颈，孕囊排出之后，再通过人流手术选择终止妊娠，手术后一个月内不允许同房，半年之内不允许再次怀孕。