手指甲有针眼状小坑可能与缺乏维生素、甲癣等原因有关，建议对症治疗。具体分析如下：
1.缺乏维生素：如果手指甲缺乏维生素，甲床营养不良，可能会出现针眼状小坑，同时还可能伴有指甲变厚、甲床分离等情况。建议平时可以多吃鱼、虾、牛奶、胡萝卜等食物来改善症状。
2.甲癣：甲癣是皮肤癣菌侵犯甲板及甲下而引起的疾病，一般表现为甲增厚、甲质松碎、刺激性小坑等。建议患者可以通过激光治疗使用激光照射在局部，通常对病原菌有一定的抑制作用，能够改善症状。