怀孕100天才有胎心胎芽也属于正常的现象。怀孕100天才有胎心胎芽，很可能是平常月经周期比较长，比如周期为两个月或三个月等。月经周期长，排卵就晚，怀孕也会随着晚，所以胎心胎芽也会相对晚才能够探及到。如果平常月经规律，怀孕100天后才有胎心胎芽，很可能是胚胎发育迟缓，需要做各项相关的检查，如果确定是胚胎发育不良，及时终止妊娠。