可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。