第一、是发病原因的差异，甲状腺炎的病因不一样。甲亢病因主要为碘缺乏和抗甲状腺药物治疗不当导致甲状腺功能亢进，而甲状腺肿大可能与内分泌紊乱相关。急性甲状腺炎是由于细菌感染所致，亚急性甲状腺炎和病毒感染有一定的关系，慢性甲状腺炎属于自身免疫性炎症，甲亢属于自身免疫功能性疾病。
第二、是发病机制的差异，甲状腺炎由病原微生物或甲状腺抗体引起的，侵袭甲状腺组织细胞，造成甲状腺滤泡细胞的损害，属器质性病变。
第三、临床表现不同，有原发性和继发性之分。普通甲亢无甲状腺局部疼痛及压痛感，它的特征是甲状腺弥漫性增大和眼的凸出，甲状腺所致甲状腺功能亢进期在1~3个月。
第四、诊断方法不一。甲状腺所致之假甲状亢，除甲亢自身症状，也可伴有局部疼痛，压痛等症状。