甲状腺疾病最常见的发病原因就是自身免疫性疾病，与遗传并没有多大关系。
人体免疫系统的异常引起机体对甲状腺的抗体含量增高，引起甲状腺的机能失常，产生的甲状腺激素含量也会发生变化。甲状腺疾病的发病原因，与本身免疫有关。还有甲状腺的肿块分为良性和恶性两类，实际上，甲状腺病也有遗传因素，临床上常见的家族性甲状腺疾病，不过这个遗传只是有几率的，并不能保证遗传就必然得了甲状腺疾病。