一般只考虑亚急性甲状腺炎有病毒感染的可能，因为病毒在感染1-3个星期后发生，不过还没有确定具体的病因，其他类型的甲状腺炎通常不是病毒感染导致的。
亚急性甲状腺炎的原因并不清楚，就像是亚急性甲亢一样，是一种病毒导致的，亚急性甲状腺炎的主要症状有高烧、有刺痛感，初期可能是甲状腺机能亢进，要结合临床表现和甲状腺功能测试来确诊，必要时可以服用口服抗炎药或者激素药物。