通常情况下，桥本甲状腺炎是雌激素的作用、遗传基因细菌或病毒引起的。
桥本甲状腺炎又称慢性淋巴细胞性甲状腺炎，是一种自身免疫性疾病，病因不明，以女性居多，具有家族聚集性，可能与雌激素、遗传基因有关。临床研究表明，桥本甲状腺炎与高碘饮食的关系密切，而硒缺乏也是其发生的危险因子。桥本甲状腺炎还可由一些细菌或病毒引起。慢性淋巴细胞性甲状腺炎是一种常见的疾病。