复方脑蛋白水解物片的副作用主要为：表现在对肝脏和肾脏的损害，这和长期使用抗生素注射对肝肾的损害是如出一辙的。而且，这种损害是不可逆的。本品可通过血脑屏障，促进脑内蛋白质的合成，影响呼吸链，具有抗缺氧的保护能力，改善脑内能量代谢。