渐冻症可能是有遗传和基因的因素，部分病人有遗传和基因缺陷，通过检查可以发现基因异常，病人可以有家族史。也可能是环境因素，部分被发现长期接触重金属，比如铝，可以引起铝中毒，能够造成运动神经元损害。引起发病的主要理论是神经毒性物质的聚集、自由基使细胞膜产生损伤，以及神经生长因子的缺乏。