脑炎后遗症的治疗主要鼓励病人做主动锻炼。尽量多活动，让患肢得到运动，利于功能的恢复。药物疗法。理疗是应用电、光、声、热等物理因子预防或治疗疾病脑炎后遗症，理疗能够调整血液循环，改善新陈代谢，提高自身免疫功能，调节神经系统功能，促进组织修复等作用，应用比较广泛。